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- 厳島神社
自然と建造物が一体となった神社建築 - 石見銀山
大航海時代に世界の1／3分の銀を産出した鉱山跡 - 小笠原諸島
独自の進化を遂げた「東洋のガラパゴス」 - 紀伊山地の霊場と参詣道
神仏習合思想を反映する1200年の霊場の伝統 - 京都の文化財
日本文化の中枢である古都に残る木造建築群 - 白神山地
広大な原生ブナ林が残る動植物の聖域 - 白川郷と五箇山の合掌造り集落
厳しい自然が生み出した山里の伝統文化 - 知床
独特の食物連鎖が生んだ特異な複合生態系 - 奈良の文化財
大陸との文化的交流を示す平城京の遺産 - 日光の社寺
神仏の建造物と周囲の自然が一帯の宗教空間 - 平泉－仏国（浄土）を表す寺院、庭園及び考古学的遺跡群
東北の地に造られた仏の理想郷 - 広島平和記念碑
核兵器の惨禍を伝える負の遺産 - 法隆寺地域の仏教建造物
斑鳩の里に残る世界最古の木造建築群 - 姫路城
要塞の機能性と芸術的な優美さをもつ城郭建築 - 屋久島
屋久杉など南北2000kmの植生が凝縮する島 - 琉球王国のグスクおよび関連遺産群
海外と交流し独自文化を伝えた琉球王国の遺産